La fréquence des effets indésirables après vaccination contre la FCO* est « faible », estime l´Agence nationale du médicament vétérinaire dans un bilan établi au 31 août 2009 à partir des données de pharmacovigilance recueillies sur la vaccination FCO depuis mars 2008. « En moyenne on estime qu´environ 1 animal sur 10 000 est susceptible de réagir suite à l´administration d´un vaccin contre la FCO*», explique l´agence. Depuis le début de la vaccination, 1 183 déclarations chez les animaux ont été recueillies. Ces déclarations concernent un total de 6 627 animaux. « Ces déclarations représentent un faible pourcentage au regard du nombre de doses délivrées depuis le début de la vaccination contre les deux sérotypes 1 et 8 », rassure l´ANMV. Dans environ 50 % des déclarations recensées, les effets indésirables résultent de l´injection concomitante de 2 vaccins.

Pour éviter que la grippe A/H1N1 ne contamine les élevages de porcs en France, l´Afssa* recommande la vaccination préventive des éleveurs, que les exploitants ayant contracté la maladie évitent le contact avec les animaux ou qu´ils le fassent en portant des masques et une tenue de protection spécifique. « A l´heure actuelle, il n´y a pas d´élevage de porcs contaminé en France », précise l´Afssa, mais elle estime « très probable » que cela se produise prochainement. La maladie n´est pas dangereuse pour les porcs mais ces animaux pourraient constituer un réservoir de virus transmissible à l´Homme. En limitant la présence du virus dans les élevages, cela diminue, en outre, le risque d´émergence d´une nouvelle souche plus virulente. L´Afssa estime que le risque de transmission aux volailles (dindes notamment) est quasi nul.